XB-CLONE-3636993
Clone Name: IMAGE:7662483
|
Gene:
prelp
|
Species: Xenopus tropicalis
|
|
|
Sequence:
Full length sequence: BC136063 [+]
GAAAAAAGCCCACCTGTATACAGCCGGCCACAGCCGTTACAGGCTCCCCAGTAAGTTATAATTGGATCCCAAAAGTTGACTATGAGAGCCCAGGTTATTC
TCCTCATTCCTTTGATCTTGATTTTGATCTTTGAGGTGAATGGTCAGCGACGCAAACCACGGCCCACAGTGGTTCGACCTCCTAAGAAGCCTACTCCACC
AGCACGAGAACCTGTAGAACCAACTGAGTTGCCTCCTCCTCTTCCTCCAGGACCTCCATCTGTCTTTCCAGACTGCCCCCGTGAATGCTTCTGTCCTCCC
GATTTTCCATCCACAATCTACTGTGACAGCCGCAACCTGCGCAAAGTACCAACCCTCCCTAACCGTGCCCGTTATGTCTATCTGCAAAACAACTTTATTG
ATGATCTGCAAGAGGAGTCTTTTAAAAATGCAACAGAAATACAGTGGATTAACCTGGACAATAATCGCATCAAAAAGGTGGAAAAGAAAATCTTGGAAAA
GATGAATAACTTAACCTATTTATATCTAGAGAAAAACCAACTAAAGGAGATGCCATCTTATTTGCCCTCAAGACTAGAGCAGCTTCGCCTTAGCCGCAAT
CAAATATCCAAGATACCTTCAGGGGTATTCAGCAAGATGGAACACTTGGTCTTACTGGACCTGCACCACAACAAACTGAGTGATGGAGGCTTTAGCAAAA
ATACATTCAAAGGCCTTAAGAACCTTATTCAGCTAAATCTAGCCCACAATATTCTGAGGAAGATGCCTCAAGCAGTTCCTGAGTCTGTCAATCAGTTATT
TCTAGACAGAAATAATATAGAGGACATTCCAGCAGACTACTTTAAGGAACTCCCTAACTTGGCCTTCTTAAGACTCAATTACAACCAGCTCTCTGATAAA
GGATTGCCTAAAAACTTATTTAATGTGTCCAGCCTCCTGGTACTGCAGCTTGCCCACAACAAGTTAACAGTGGTTCCACCAATTAGCATCAAGCTGGAAC
ATCTATATTTGAATGACAACATAATTGAAAAGATTAATGGCACAGAGATATGCCCAGCTCCTCTAGTTCCATTTGACTTTTCATCCAGGGATTTGTCTTC
TGTTCCCCGGCTGCGATACCTTAGGCTGGATGGAAATCAACTGAAGCCCCCAATACCCCTGGATGTTATTATGTGCTTCCGTCTCCTGCAATCTGTTGTC
ATCTGATAAATGTAACACTGCTCAACAATAAACACTGATATATACTCTTTTGTAAAGTAACTCCACAATCCACAATGCTAGACTAACATAAACTCATATT
GCAATGCCCAATGCACTAATAACAATGACACCTATTTTCACATTCTGCTTTAAAGCCGCACATTACCAGATGCTGCAGTTCAGGGTTTATTATAAGTGGA
GTTATCAGTGTCTGTTGTAAATGGTCTGCCAGGAAGCTGTTACAGTGCTATAAAAATAGGACATAATGGGAAGTATTTGAAATTACAAATTCCCTCTTTT
CAAATTTGATGTTGCAGAGCAAGCAAAACAGATTATATTGATTATATGGCAAATGTTGTACCAAAGTTACTGCAGTTAAAAAAAAGCTGCTTTCATTAAT
GAGTAATTTTTGTGCCATTTTAAATCGAATAAAAAAATGAATTAAAAATGAAATCAAATTAATCATTTTGTGTCATTTCTGTGACACTATTTTAGCATAA
CATATGTTGCTAAAATGATAATGACCTGACTCATGTGTATCCACAGGTGCAGGGGATTAACTAGGGAGGAGAATCTGAATGTTTTGATGCTCGCGTTTTG
AGCTATAAAATGCTCAAGTTACAAATGTGCAGAATCACCCTATCAGTTATTACATTTAGGCTACAAAGAACGCACTACCAATTGTTCTGCAGACAAACCA
ACAAATTATGGGAATTGAAAACCTGTAGATTTTAAATTAAATATCGTTCCCAGAAATCACTGAAAGTCAGCTGTTCCACACTGGGAGCCAATTTAAAGGT
TGATTGGAGACTTTCCTTGTGTCTATTCATGGTAATGTAAGGCTGATGCCACACCATGCGTATGGCATATATTTGGGTGCAGGCACAGGTAGGAGCATAT
GGTGCGTATGGCGTGTGCCGAAAATATACACCATACGCTAAGTGTGGCATTAGCCTTAGCCTTAACCTAACTAATAGTAGTTACTATTAAAGAACTAATT
AAATCTGAACTGAAAGTTATGTCTGTACTAAACTTTGTGCTCTGGCAAGATTTCTTTTCTGGCTGGGGGGTGCATTAAACAAATACATGCTAATTTAGAT
TAGAACATTTTTTATACTAATGCCTCACTTTTTCTTCTTTAAGAGGCAAGGCACACAGACGTTCAAAATATGCAGTATTTTTTTAATTTAGATTAGAACA
TTTTCTATACTAATGCCTCACTTTTTGTTCTTTAAGAGGCAAGGCACACAGACGTTCAAAATATGCAGTATTTTTTTAAGCAAACCACATTGATTAAAAT
GGCCATCCATAGATAGACAATATCTCTGACAGATGCTGCTTTGAAAAAGTTGGTATTTCTTGGGAACACAGTCTAGCAAGTTTTATGTGAATGGGAAGCT
AAAATATGGGCATTTTCAAAGCAAAAGTTGTCCATGAGAGCACTTAGGTAAGAAATACTTATATTCCAAGTTGGCTGCTTTTATTGGCCAATGTATGGCC
AGCTTAACACACCAAAACAGCACTAATTGAACTTAACCCTTCCCCTAACTCCAGGTCACCTCTATCAACCTTTCTTCCTGCAGCCTTCCCGCACCACCCA
TACTGTCAAAAGTGTCCCTATCTTTGAACCCATCTTTCTATACAGAGTTGGCATGCAACATATCACGCCGCTTTGGATCCACTTCTGATCTTTGTTTTTG
TTTTGTAACTTTTAGTTGAACATTCAAATCTAACTGCTTATTGGTTGCTATGGGCAACATTACCGGTGATGCTGGCTTACACACTGTAATAAATATGGTC
CTTGACAGTAGGGGTGGTGTGGGGATGGAGCAAGGCCGGTGGAGGAAGCTTGAGGTTGGGAGGAGGGTTTCATTCTCTTTACCCAAGTCCCATTGTAGTA
TGCTATTTGATTTATATTTGAGTTATATCATGTCCCTATTATCTCAATACCTTGTATTGAGAAAGAATGTGCCTTCCTCCAGCTGAAGTATGTCTTTACT
TGATTTTCCGGCTCTGCAAACTGACTGGGCCCATGATAAAATATAATATTCAACCTGACTATTTGGGACAAACTTGTAAATATACAATCTACAAAGCCAG
TAGACTGTTCTGTTCAAATATGCTTACAACTGTACTTTTATATTGCTATGCTATTAATTTTAAAAACAAAAAAAACCTTTTGAATACACTGATAAGATCT
CACCATTTATTTATACAGAATACTTAACAATACATTACAATTGGGCATAATCACACACTTACAACAAATTGTTGGCTGCATATATTTCCTCCTCTTCATA
TTTCTAAAATCCAATGATCATATTTCTTTCAACAACATTTTTTCAAAAGAAATGTACAGTTTTTTTATATTTTTTTGTTACAAAAAGTCTGCTTGTATAT
GGCACATGTATTTGCATGTAAATGTATATATCCACAATATATGCAATTGTGTTTATCAAATATATAATCTACAAAGTCTGTTTTAGACTAAACAGCTACC
TTCCAGCCCCAATATTCACTTGTGACTTGACTCCAGAAGTGATGTGTAAGGGTAAAGAATGGCAAAATCAATAAAGCTTCTGAAATTTTGTTCAAAAAGC
AGTATGTACAATCAGGTCCACATAATGGGCATTTTCAAACAACTCTAATAGTGCTAACGTTGGTAAGTAAGTTGCTGCACTGCAAATTTAAAATAAAGAG
TCTGGGGTTGTGAAGATAGATTCAATGCTTCTGTAATTCCTGCACTTCCCCCCCAGAAACACCTCTGTTATGTTTTAACAAATTAAACATATACTATTAT
GATTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
5' EST: CX844469 [+]aaaaagcccacctgtatacagccggccacagccgttacaggctccccagtaagttataattggatcccaaaagttgactatgagagcccaggttattctc
ctcattcctttgatcttgattttgatctttgaggtgaatggtcagcgacgcaaaccacggcccacagtggttcgacctcctaagaagcctactccaccag
cacgagaacctgtagaaccaactgagttgcctcctcctcttcctccaggacctccatctgtctttccagactgcccccgtgaatgcttctgtcctcccga
ttttccatccacaatctactgtgacagccgcaacctgcgcaaagtaccaaccctccctaaccgtgcccgttatgtctatctgcaaaacaactttattgat
gatctgcaagaggagtcttttaaaaatgcaacagaaatacagtggattaacctggacaataatcgcatcaaaaaggtggaaaagaaaatcttggaaaaga
tgaataacttaacctatttatatctagagaaaaaccaactaaaggagatgccatcttatttgccctcaagactagagcagcttcgccttagccgcaatca
aatatccaagataccttcaggggtattcagcaagatggaacacttggtcttactggacctgcaccacaacaaactgagtgatggaggctttagcaaaaat
acattcaaaggccttaagaaacttattcagctaaatctagcccacaatattctgaggaagatgcctcaagcagttcctgagtctgtcaatc
3' EST: CX844468 [+]caaaatcataatagtatatgtttaatttgttaaaacataacagaggtgtttctgggggggaagtgcaggaattacagaagcattgaatctatcttcacaa
ccccagactctttattttaaatttgcagtgcagcaacttacttaccaacgttagcactattagagttgtttgaaaatgcccattatgtggacctgattgt
acatactgctttttgaacaaaatttcagaagctttattgattttgccattctttacccttacacatcacttctggagtcaagtcacaagtgaatattggg
gctggaaggtagctgtttagtctaaaacagactttgtagattatatatttgataaacacaattgcatatattgtggatatatacatttacatgcaaatac
atgtgccatatacaagcagactttttgtaacaaaaaaatataaaaaaactgtacatttcttttgaaaaaatgttgttgaaagaaatatgatcattggatt
ttagaaatatgaagaggaggaaatatatgcagccaacaatttgttgtaagtgtgtgattatgcccaattgtaatgtattgttaagtattctgtataaata
aatggtgagatcttatcagtgtattcaaaaggttttttttgtttttaaaattaatagcatagcaatataaaagtacagttgtaagcatatttgaacagaa
cagtctactggctttgt
Library:
Description: PolyA+ RNA was primed with oligo-dT primer 5'-GACTAGTTCTAGATCGCGAG CGGCCGCCCTTTTTTTTTTTTTTT-3'. cDNA was ligated to SalI adapter (5'-TCGACCCACGCGTCCG-3' and 5'-CGGACGCGTGGG-3'), digested with NotI, size fractionated in 1.1% agarose gel electrophoresis and ligated into SalI and NotI digested pCMV-SPORT6 vector. Library contains the 1.5-2 kb size fraction (additional size fractions contained in the NIH_XGC_tropBrn2 and Brn4 libraries). Library constructed at the DOE Joint Genome Institute.Anatomy: brain | Stage: frog |
Normalized: No | Subtraction: No |
Vector Details | Vector Map |
Name: pCMV-SPORT6
Type: phagemid
5' Restriction Site: SalI
3' Restriction Site: NotI | |
Usage:
Suppliers: